具体的な庫内作業としては、まず入庫した商品を「天カットエリア」で事前に段ボールケースの天面をカットして「ケース自動倉庫」（マイナス25℃、４３２０ケース）へ投入。ケース自動倉庫から出庫された商品は、「商品補充庫」（マイナス15℃）でケースのバーコードを読み取り、自動で棚に補充される。商品補充庫では補充作業を完全自動化し、低温度帯での人力での作業をなくすことで補充ミスを防止。同所での取り扱い可能品目数は計４８６品目となり、南大沢センターの４３８品目を上回る能力を確保した。

　
　棚に補充された商品は、２本の「集品ライン」（５℃）で組合員ごとにピッキングする。集品ラインの全ての棚にはウェイトチェッカー付きの商品自動投入機を標準装備してセットミスを抑止するとともに、集品後の箱の中をカメラで録画することで業務改善にも活かす。エリア内には冷凍機から出る廃熱を利用して空間を温める「ヒートリクレイム装置」を設け、室内が冷えすぎないよう温度バランスを保つ。

　商品が詰め合わされた大型保冷容器は自動積み付け機で専用台車に積載されるが、積み付け機も南大沢センターでは１ラインあたり１基稼働していたが、つくばみらいセンターは２ラインで１基の稼働とすることで作業効率の向上と少人化を図った。セット後の商品をトラックに荷積みするまでは入出荷待機冷凍庫（マイナス25℃）で一時的に保管し、同所には１日分の物量と翌日使用分の商品を保管するスペースを確保した。

　同施設は、大規模災害発生時のリスク分散などを目的に開設することから、受電設備は水海道変電所と福岡変電所の２回線受電を完備し、落雷などでも稼働を止めないよう対策を講じる。

　環境面にも配慮し、全館ＬＥＤ照明とするとともに、一部には太陽光照明を用いて自然光を利用することで電気使用量を削減。共用エリアは人感センサーで無人時も10％の照度を保つほか、時間帯により照明の色も変化させる。今年度中には全量自家消費を目的とした太陽光発電設備を設置する計画。屋外には、太陽光と風力エネルギーを用いたハイブリッド街灯照明２基も設けた。

　ケース自動倉庫と入出荷冷凍庫にはＣＯ２自然冷媒（Ｒ７４４）機器を使用し、省エネと地球温暖化係数（ＧＷＰ）＝１に配慮。トラックヤードにはスタンバイ電源装置を設け、エンジンをかけない状態での車両の冷やし込みを可能とする。これらに加え、東日本大震災復興支援活動として、宮城県三陸町より間伐材を仕入れ、休憩室内の腰壁やウッドデザインに使用した。

　７月23日には開所式が開かれ、大信理事長は「新センターの開設により、冷凍商品の品揃えの柔軟度が高まりアイテム増が可能になる。この施設が、近隣の方々とともに歩み、供給商品を組合員に喜んでもらえるようになりたい」と挨拶した。

　また、来賓として出席した日本生活協同組合連合会の土屋敏夫代表理事会長は「現在、冷凍食品事業は生協の基幹的な商品の核であり、冷凍食品の注文増と質向上に対応するとともに、物流全体のリスク分散にも大きな意味を持つ拠点となる」と祝辞を述べた。

　開所式では鏡開きも開かれた。